Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 COS4YFL062W 1140 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 MRP4YHL004W 1185 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 AAD10YJR155W 867 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YKR047WYKR047W 306 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 POM33YLL023C 840 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 IRC19YLL033W 693 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YAR030CYAR030C 342 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YLR184WYLR184W 348 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 PUS4YNL292W 1212 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 ATG34YOL083W 1239 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 SPP381YBR152W 876 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 PGM1YKL127W 1713 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YMR1YJR110W 2067 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 NOG2YNR053C 1461 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 RIO1YOR119C 1455 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 TRM1YDR120C 1713 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 HXT3YDR345C 1704 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 ERC1YHR032W 1746 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 STE12YHR084W 2067 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 UTP7YER082C 1665 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 SLC1YDL052C 912 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 MHF2YDL160C-A 243 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 FAL1YDR021W 1200 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YDR203WYDR203W 318 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YEL010WYEL010W 351 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 LYS5YGL154C 819 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YGL159WYGL159W 1113 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 PUP2YGR253C 783 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 RPF1YHR088W 888 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YHR180WYHR180W 492 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YIL152WYIL152W 708 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YJL007CYJL007C 315 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 SNX4YJL036W 1272 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 GLG2YJL137C 1143 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YNL058CYNL058C 951 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YNL324WYNL324W 396 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YPR076WYPR076W 375 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 GIT1YCR098C 1557 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 DAL4YIR028W 1908 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 VPS4YPR173C 1314 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 ATG7YHR171W 1893 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 KIN28YDL108W 921 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YDR018CYDR018C 1191 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 TAF10YDR167W 621 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 COQ4YDR204W 1008 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 GPI11YDR302W 660 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 AGX1YFL030W 1158 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YGR122WYGR122W 1209 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YKL162CYKL162C 1209 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 BUR2YLR226W 1188 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 UTP5YDR398W 1932 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 RSC2YLR357W 2670 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 JIP4YDR475C 2631 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 RDS2YPL133C 1341 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YHK8YHR048W 1545 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YGR126WYGR126W 693 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YGR290WYGR290W 444 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 AIM46YHR199C 933 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YHR214WYHR214W 612 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 SFC1YJR095W 969 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YAR066WYAR066W 612 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YNL203CYNL203C 612 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YOL046CYOL046C 675 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 ARR3YPR201W 1215 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 SIP5YMR140W 1470 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 GAS2YLR343W 1668 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 MRE11YMR224C 2079 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 TKL2YBR117C 2046 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 CLG1YGL215W 1359 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 PRO2YOR323C 1371 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 APJ1YNL077W 1587 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 KTR6YPL053C 1341 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 PFK2YMR205C 2880 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 ARC15YIL062C 465 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 QCR8YJL166W 285 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 MDE1YJR024C 735 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YML053CYML053C 639 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 IML2YJL082W 2196 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 PPM1YDR435C 987 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 MXR1YER042W 555 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YGL117WYGL117W 798 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 COS12YGL263W 1143 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 MMF1YIL051C 438 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YML6YML025C 861 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 TRI1YMR233W 681 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 DYN3YMR299C 939 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YNL146WYNL146W 303 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 PNT1YOR266W 1272 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 FDH2YPL275W 711 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 NRG2YBR066C 663 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 SPO1YNL012W 1896 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 UGO1YDR470C 1509 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 CDC34YDR054C 888 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 SPT15YER148W 723 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 TYW3YGL050W 822 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YGR293CYGR293C 462 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YML003WYML003W 873 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-NL1Q12391 YBR300CYBR300C 498 nt5.78□□□□□ -1.48
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