Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 YER134CYER134C 537 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 CAF16YFL028C 870 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 DSD1YGL196W 1287 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YAR061WYAR061W 204 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 NIT3YLR351C 876 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 MRP21YBL090W 534 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 NCE102YPR149W 522 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 QCR2YPR191W 1107 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 MED8YBR193C 672 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 APA1YCL050C 966 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 DOA1YKL213C 2148 nt5.08□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 MAK11YKL021C 1407 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 ESC2YDR363W 1371 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 PRO2YOR323C 1371 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 HMRA1YCR097W 381 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 KEG1YFR042W 603 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YPT32YGL210W 669 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YGR122WYGR122W 1209 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 PAN6YIL145C 930 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YLR124WYLR124W 345 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SNO4YMR322C 714 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 PIN2YOR104W 849 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 IPP1YBR011C 864 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 HSP33YOR391C 714 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YPL073CYPL073C 486 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 POC4YPL144W 447 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 snR17bsnR17b 332 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 HSP32YPL280W 714 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 TDA7YNL176C 1911 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 BRE2YLR015W 1518 nt5.07□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 CLA4YNL298W 2529 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 ROT2YBR229C 2865 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 MTC1YJL123C 1437 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 ATG20YDL113C 1923 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 CRT10YOL063C 2874 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SCW4YGR279C 1161 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SIC1YLR079W 855 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 TAP42YMR028W 1101 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YMR245WYMR245W 621 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 GRX5YPL059W 453 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 APM3YBR288C 1452 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SDA1YGR245C 2304 nt5.06□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 MNS1YJR131W 1650 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SSU1YPL092W 1377 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SIF2YBR103W 1608 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 RAD16YBR114W 2373 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 UTR4YEL038W 684 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SPO11YHL022C 1197 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SPC3YLR066W 555 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YML018CYML018C 1182 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SNO1YMR095C 675 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YNR025CYNR025C 360 nt5.05□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 CLF1YLR117C 2064 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 PCA1YBR295W 3651 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 ECM18YDR125C 1362 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SAD1YFR005C 1347 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 UBX7YBR273C 1311 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 CDC19YAL038W 1503 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 NUP42YDR192C 1293 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 BMH1YER177W 804 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YJL032WYJL032W 315 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 UIP3YAR027W 708 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SMD3YLR147C 306 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 HEK2YBL032W 1146 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 RPL21BYPL079W 483 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YPR027CYPR027C 834 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 BLM10YFL007W 6432 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 MLF3YNL074C 1359 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 ALG1YBR110W 1350 nt5.04□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 ZUO1YGR285C 1302 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 NUP116YMR047C 3342 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SUR2YDR297W 1050 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 RPB4YJL140W 666 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SEN34YAR008W 828 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 SPC2YML055W 537 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YMR181CYMR181C 465 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YPR015CYPR015C 744 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YPR153WYPR153W 423 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 YCL012CYCL012C 405 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 IXR1YKL032C 1794 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 AXL2YIL140W 2472 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 PRR1YKL116C 1557 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 RFT1YBL020W 1725 nt5.03□□□□□ -1.6
TAF3Q12297 ABF1YKL112W 2196 nt5.02□□□□□ -1.61
TAF3Q12297 SLM5YCR024C 1479 nt5.02□□□□□ -1.61
TAF3Q12297 YLR108CYLR108C 1458 nt5.02□□□□□ -1.61
TAF3Q12297 YJL206CYJL206C 2277 nt5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.7 ms