Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 DUG1YFR044C 1446 nt5.96□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 YAR030CYAR030C 342 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 UBP7YIL156W 3216 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 JIP5YPR169W 1479 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 GDE1YPL110C 3672 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 BIK1YCL029C 1323 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 BOP2YLR267W 1713 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 MRT4YKL009W 711 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 YMR130WYMR130W 909 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 CLF1YLR117C 2064 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 ARG4YHR018C 1392 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 MRPL7YDR237W 879 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 YDR271CYDR271C 372 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 SKG6YHR149C 2205 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 RIP1YEL024W 648 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 CLA4YNL298W 2529 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 DAL4YIR028W 1908 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 NUP2YLR335W 2163 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 RMD1YDL001W 1293 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 BNA1YJR025C 534 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 YML131WYML131W 1098 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 MET3YJR010W 1536 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 JLP1YLL057C 1239 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 YLR049CYLR049C 1287 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1B-BRQ12193 COX19YLL018C-A 297 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 URA4YLR420W 1095 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 AAP1YHR047C 2571 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 CDC4YFL009W 2340 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 ERG7YHR072W 2196 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 FUN30YAL019W 3396 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 CMK1YFR014C 1341 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 HSP104YLL026W 2727 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 POF1YCL047C 777 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 LCB2YDR062W 1686 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 MDL1YLR188W 2088 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 YNR061CYNR061C 660 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 NUP1YOR098C 3231 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 CHK1YBR274W 1584 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 OAR1YKL055C 837 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 CAT5YOR125C 702 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 NOG1YPL093W 1944 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 ADE6YGR061C 4077 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 PPG1YNR032W 1107 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 CDC15YAR019C 2925 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 PEX30YLR324W 1572 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1B-BRQ12193 DAL81YIR023W 2913 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 NRK1YNL129W 723 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 PBN1YCL052C 1251 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 NMT1YLR195C 1368 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 AIM3YBR108W 2844 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 RAD2YGR258C 3096 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 LCB5YLR260W 2064 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 YLR296WYLR296W 327 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 CTT1YGR088W 1689 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 ALG9YNL219C 1668 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 ALT2YDR111C 1524 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 AGE2YIL044C 897 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 TSL1YML100W 3297 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 STE23YLR389C 3084 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 PRD1YCL057W 2139 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 TRM8YDL201W 861 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 SFK1YKL051W 1062 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 SDO1YLR022C 753 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 COQ5YML110C 924 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 UBP10YNL186W 2379 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 ARC40YBR234C 1155 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 HXT7YDR342C 1713 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 HXT6YDR343C 1713 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 MSB2YGR014W 3921 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 YDR056CYDR056C 618 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 YEL074WYEL074W 339 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 GLE2YER107C 1098 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 TIM12YBR091C 330 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 TGL4YKR089C 2733 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 SOL4YGR248W 768 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 GPP1YIL053W 753 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 MAD2YJL030W 591 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 RPS1BYML063W 768 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 IMP4YNL075W 873 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 MRP21YBL090W 534 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 DIN7YDR263C 1293 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 YBL036CYBL036C 774 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 YIM1YMR152W 1098 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BRQ12193 SLN1YIL147C 3663 nt5.77□□□□□ -1.49
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