Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ID3Q02535 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ID3Q02535 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ID3Q02535 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms