Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER3P43115 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER3P43115 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms