Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Ab1P01921 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-Ab1P01921 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-Ab1P01921 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms