Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM2O94769 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM2O94769 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM2O94769 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM2O94769 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM2O94769 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM2O94769 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM2O94769 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM2O94769 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM2O94769 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM2O94769 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM2O94769 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM2O94769 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM2O94769 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM2O94769 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM2O94769 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM2O94769 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM2O94769 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM2O94769 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM2O94769 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM2O94769 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM2O94769 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM2O94769 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM2O94769 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM2O94769 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM2O94769 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM2O94769 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM2O94769 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM2O94769 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM2O94769 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM2O94769 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM2O94769 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM2O94769 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM2O94769 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM2O94769 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM2O94769 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM2O94769 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM2O94769 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM2O94769 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM2O94769 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM2O94769 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM2O94769 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM2O94769 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM2O94769 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM2O94769 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM2O94769 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM2O94769 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM2O94769 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM2O94769 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM2O94769 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM2O94769 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM2O94769 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM2O94769 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM2O94769 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM2O94769 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms