Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMPCBO75439 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMPCBO75439 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMPCBO75439 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms