Protein–RNA interactions for Protein: O00213

APBB1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB1O00213 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBB1O00213 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBB1O00213 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBB1O00213 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBB1O00213 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APBB1O00213 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APBB1O00213 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBB1O00213 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBB1O00213 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBB1O00213 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBB1O00213 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBB1O00213 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APBB1O00213 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBB1O00213 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBB1O00213 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBB1O00213 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBB1O00213 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBB1O00213 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APBB1O00213 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APBB1O00213 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APBB1O00213 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
APBB1O00213 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APBB1O00213 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APBB1O00213 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APBB1O00213 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB1O00213 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB1O00213 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB1O00213 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB1O00213 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB1O00213 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APBB1O00213 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APBB1O00213 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APBB1O00213 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APBB1O00213 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBB1O00213 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBB1O00213 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBB1O00213 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBB1O00213 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APBB1O00213 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBB1O00213 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBB1O00213 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBB1O00213 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APBB1O00213 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBB1O00213 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBB1O00213 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBB1O00213 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
APBB1O00213 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBB1O00213 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APBB1O00213 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
APBB1O00213 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APBB1O00213 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
APBB1O00213 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms