Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo5cE9Q1F5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo5cE9Q1F5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms