Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB8E9PQR5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPIPB8E9PQR5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.9 ms