Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSPP1Q1MSJ5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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