Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPB2P35606 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms