Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PACSIN2Q9UNF0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms