Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms