Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms