Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKOR1P84550 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SKOR1P84550 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SKOR1P84550 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms