Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms