Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms