Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms