Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms