Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3C6Q969F1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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GTF3C6Q969F1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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