Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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