Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP46P62068 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP46P62068 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP46P62068 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP46P62068 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP46P62068 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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USP46P62068 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP46P62068 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USP46P62068 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
USP46P62068 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
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