Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms