Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP2AP11388 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms