Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms