Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRXP46100 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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