Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL3Q9Y4R7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL3Q9Y4R7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms