Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms