Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FZD1Q9UP38 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD1Q9UP38 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms