Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJD2Q9UKL4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJD2Q9UKL4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD2Q9UKL4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms