Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD1Q9UIS9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms