Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CPA4Q9UI42 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPA4Q9UI42 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPA4Q9UI42 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms