Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SRP68Q9UHB9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms