Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBF3Q9H4W6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF3Q9H4W6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms