Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnn3Q9DAW9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn3Q9DAW9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms