Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med11Q9D8C6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Med11Q9D8C6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Med11Q9D8C6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med11Q9D8C6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med11Q9D8C6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med11Q9D8C6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med11Q9D8C6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Med11Q9D8C6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms