Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNTNAP4Q9C0A0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP4Q9C0A0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP4Q9C0A0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms