Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMD1Q99460 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms