Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TNFRSF13CQ96RJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFRSF13CQ96RJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms