Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM227BQ96M60 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM227BQ96M60 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM227BQ96M60 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms