Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C7orf43Q8WVR3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C7orf43Q8WVR3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C7orf43Q8WVR3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C7orf43Q8WVR3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
C7orf43Q8WVR3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms