Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WHAMMQ8TF30 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WHAMMQ8TF30 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WHAMMQ8TF30 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WHAMMQ8TF30 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WHAMMQ8TF30 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WHAMMQ8TF30 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms