Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHBDD1Q8TEB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHBDD1Q8TEB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD1Q8TEB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms