Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VWDEQ8N2E2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
VWDEQ8N2E2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VWDEQ8N2E2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms