Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB11FIP4Q86YS3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms