Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLNKQ7Z7G1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLNKQ7Z7G1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms