Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC186Q7Z3E2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC186Q7Z3E2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC186Q7Z3E2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC186Q7Z3E2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC186Q7Z3E2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC186Q7Z3E2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC186Q7Z3E2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC186Q7Z3E2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC186Q7Z3E2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC186Q7Z3E2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms