Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBR3Q6ZT12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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